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유전체 Web Database
새로운 Genome이 완성되면 유전체 정보를 활용할 수 있도록 Genome을 해석한 데이터베이스를 구축합니다. 제공되는 데이터는 다음과 같습니다.
Genome 해석 DB
- 통합 Genome browser 구축
- de novo Assembly를 통해 생산한 Scaffolds sequence 및 정보
- 생성한 Scaffolds를 기반으로 예측된 Gene, Protein sequence 및 위치 정보
- 다양한 공개 Database와의 Annotation을 통해 얻은 정보 (ex:InterProScan)
- GO(Gene Ontology), KEGG pathway 정보
(실 DB구축 예1) 배추 유전체, 전사체 정보 이용 통합 DB - genome browser 화면
(실 DB구축 예2) Cyanobacteria genome assembly 결과를 활용한 genome browser