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Gene Ontology analysis Gene Ontology는 유전자 기능 연구를 위해 개별 유전자에 대해 유전자가 관련된 세포 기작(biological process), 분자 기능(molecular function) 및 세포 내외 위치(cellular component)에 따라 구조화된 모델로, 해당 분석을 통해 Functional annotation을 얻을 수 있습니다. 관심있는 유전자의 기능을 분석하기 위해 Gene Ontology DB와 대조하여 Gene annotation을 수행하고 통계적인 방법을 통해 유의한 결과를 얻을 수 있습니다. Read more

KEGG analysis KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)는 생화학 Pathway 관련 데이터베이스로, 해당 분석을 통해 Functional annotation을 얻을 수 있습니다. 대상 유전자들을 KEGG DB와 비교하여 유전자들이 어느 Pathway에 관여하는지 결과를 얻을 수 있습니다. 또한 관심있는 Pathway의 어느 단계에서 유전자의 발현이 변화되는지 KEGGmapper나 MAPMAN과 같은 프로그램을 통해 Visualization 할 수 있으며, 통계적인 방법을 통해 P-value 값에 따라 유의하다고 판단되는 Pathway를 Plot으로 표현할 수 있습니다. Read more

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Gene profiling