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원품종과 돌연변이 계통 간의 Structural variation analysis 구조변이 (Structural variation)는 일반적으로 동일한 종의 개체들 사이에서 결실(deletion), 삽입(insertion), 중복(duplication), 역위(inversion) 및 전좌(translocation)를 포함한 변이를 말합니다. 단일 염기 다형성 (Single Nucleotide Polymorphism; SNP)이나 Small insertion/deletion 에서는 확인할 수 없었던 50bp이상의 크기가 큰 구조적 변이를 탐색할 수 있습니다. 정확한 SV 판별을 위해 Supporting read-pair counts를 제공하며, Breakpoints를 통해 구조변이 위치 및 크기 식별이 가능합니다. SV결과는 Mapping bam파일을 통해 가시화하여 확인할 수 있습니다. 인위적으로 방사선을 조사한 돌연변이 계통과 원품종 간의 차이를 확인하는데 특히 SV 분석이 많이 활용되고 있습니다. 감마선(gamma-rays), 양성자 빔(proton beam),… Read more

원품종과 돌연변이 계통 간의 SNP, In/Del analysis 단일 염기 다형성 (Single Nucleotide Polymorphism; SNP)이나 Small insertion/deletion polymorphism은 유전체에서 가장 빈번하게 발생하는 다형성으로, 유전적 다양성 및 표현형 변이에 기여하고 있습니다. 감마선(gamma-rays), 양성자 빔(proton beam), 이온화 방사선 (Ionizing radiation) 등 다양한 유형의 방사선 처리에 따라, 또는 방사선 선량 강도에 따라 발생하는 돌연변이의 유형을 SNP와 Small In/del 수준에서 원품종과 돌연변이 계통 간의 변이를 확인할 수 있습니다. Read more

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Structural variant