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유전지도 작성 유전지도 작성은 기존 Reference가 있는 작물의 경우, 형질과 연관된 영역을 탐지하거나, 새로운 Pseudomolecules을 작성하는데 기반이 될 수 있습니다. 유전지도는 육종 연구에 주로 사용되는 F1, F2, RIL(Recombination Inbred Line), DH(Double Haploid) 등의 교배 집단을 이용하여 가상의 유전지도 작성이 가능합니다. 집단의 Resequencing data 또는 GBS 데이터를 이용하여 SNP를 확보하고 일정 기준 이상의 필터과정을 거쳐 선발된 SNP 마커로 Recombination frequency 등의 통계분석을 통해 Linkage map construction을 진행합니다. Read more

QTL analysis 무게나 키와 같은 질적 형질은 단일 유전자가 아닌 여러 유전자가 복합적으로 관여하며, 이 유전자의 영역을 양적 유전자좌(Quantitative Trait Loci; QTLs)라고 합니다. QTL analysis를 통해 Genome 내에서 특정 형질에 관여하는 QTLs 영역을 탐색할 수 있습니다. 분석 대상 집단의 Resequencing 또는 GBS data를 이용하여 SNP를 확보하고 일정 기준 이상의 필터과정을 거쳐 선발된 SNP 마커로 Recombination frequency 등의 통계분석을 통해 유전지도(연관지도) 작성을 진행합니다. 작성된 유전지도와 특정 형질의 표현형 값을 이용하여 QTL 영역 탐색을 할 수 있습니다 Read more

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Population genomics